泸沽湖的起源有多种传说，其中一种是在遥远的年代，这里曾是一片村庄。村里有个孤儿，每天到狮子山去放牧。人们只要把牛羊交给他，他总是把牛羊放得肥肥壮壮的。有一天，他在山上一棵树下睡着了，梦见一条大鱼对他说：“善良的孩子，你可怜了，从今往后，你不必带午饭了，就割我身上的肉吃吧。”小孩醒来后，就到山上找啊找，终于在一个山洞里发现那条大鱼，他就割下一块烧吃，鱼肉香喷喷的。第二天，他又去了，昨天割过的地方又长满了肉。这事被村里一个贪心的人知道了，他要把大鱼占为己有，就约了一些贪财之徒，用绳索拴住鱼，让九匹马九头牛一齐使劲拉，鱼被拉出洞，灾难也就降临了。从那个洞里，洪水喷涌而出，顷刻间淹没了村庄。那时，有一个摩梭女人正在喂猪，两个年幼的孩子在旁边玩耍，母亲见洪水冲来，急中生智，把两个孩子抱进猪槽，自己却葬身水底。两个孩子坐在槽里承受水漂流，后来，他们成了这个地方的祖先。人们为了纪念那个伟大的母亲，就拿整段木头做成“猪槽船”，泸沽湖也称为母亲湖。
另一种传说则是关于格姆女神的故事。格姆女神是一个聪慧美丽的姑娘，她有自己的私生活，她不仅与周围的许多男山神有“阿夏”（情侣）关系，而且与远方的男山神也有交往。有一次，一个远方的男山神来和她相会，但她正与附近一个男山神幽会，远方来的山神急忙调转马头，马嘶鸣三声，格姆女神听到马的嘶叫声，便立即追赶远方男神，而远方男神走远了，只见山下踩出一个很大的马蹄印，女神赶到马蹄印边，天已启明，就站在马蹄印边动情地哭泣，泪水哭满了马蹄印，变成现在的泸沽湖。远方的男神听到哭声，回头一望，万分留恋地撒了几颗珍珠和花种在马蹄洼的泪水里，于是变成了湖中的小岛。花种漂到边上，发芽生长，葱郁茂盛，年年开出杜鹃等数十种鲜花。
然而，从科学的角度来看，泸沽湖是由断层陷落而形成的。其面积约50余平方公里，湖水平均深度约45米。整个湖泊，状若马蹄，南北长而东西窄，形如曲颈葫芦，故名泸沽湖。
泸沽湖历史上发生过一些战争和冲突，其中包括：
1. 元朝末年的战争
蒙古族的一支部队在战争中败退泸沽湖，并定居于此，与当地的土着人走婚，繁衍后代。
2. 明朝时期的叛乱
明初，蒙古贵族月鲁帖木儿在建昌发动叛乱，率领德昌、会川、迷易、柏兴（今盐源）、邛部并西番土军万余人，杀官军男妇二百余，掠屯田、烧营屋，劫军粮，率众攻城。这场叛乱被明朝政府派遣蓝玉为总兵官督军平叛。
3. 民国年间的暴动
随着汉官势力的增强和人民意识的觉醒，土司骄奢淫逸的生活以及不断增加的苛捐杂税，逐渐引起了领地佃户和属民的不满，双方斗争与日俱增。1923年元月，彝汉各族佃户为了反抗瓜别土司所制定的苛捐杂税，开始了大规模的反抗。此次暴动导致了各土司境内的土着民族大量减少，还好左所土司在盐源属于势力较大，尚能抵抗暴动。
这些历史事件都对泸沽湖地区的发展产生了深远的影响。
泸沽湖流域的水利工程主要包括以下几个方面：
供水工程
泸沽湖女儿国镇供水项目一期工程是一个重要的供水工程，总投资1.28亿元，建设期1年，运营期10年。该项目包括取水工程、原水输水工程、净水厂、输配水管网工程等，覆盖永宁镇、泸沽湖景区、女儿国旅游小镇等8个片区，解决了泸沽湖周边没有自来水厂的历史，为当地6万多各族人民群众及国内外游客带来了福音。
生态修复工程
泸沽湖环湖生态修复工程（二期）是一个重要的生态修复工程，项目建设内容包括湖岸带生态修复及边坡治理。该项目修复和重建了已遭破坏的湖岸生态带，建立了稳定的湖岸带过渡性生态系统，恢复湖岸带生态环境，提升湖岸带景观价值，充分发挥湖岸生态带的环境净化功能，实现了湖泊生态系统的良性循环。
控湖转坝项目
泸沽湖的“控湖转坝”项目是一个重要的水利工程，该项目旨在加快推进旅游环境承载力转移到泸沽湖流域外，改善泸沽湖景区基础设施条件，提升景区服务能力水平。在景区改造提升过程中，要充分考虑好与景区自然景色的协调性和匹配度，做到景区改造工作不影响自然风光、不影响游客旅游体验，确保起到增色添美的效果。
污水治理工程
泸沽湖流域实施了污水治理工程，包括污水管网泵站改造工程、污水处理厂提标改造工程、落水村雨污分流工程、三家村及山垮村污水管网系统改造工程等重点项目建设。这些项目的实施，实现了泸沽湖云南片区生活污水收集全覆盖，处理后污水达到了一级A标排放标准。
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